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Quantifizierung von Nukleinsäuren

TrayCell Frau mit Pipette

Um den Gehalt von Nukleinsäuren in einer Lösung zu bestimmen, wird der Absorptionswert der Lösung bei 260 nm (A260) verwendet. Folgende, aus dem Lambert-Beerschen Gesetz abgeleitete Berechnung, kommt zur Anwendung:

Konzentration [ng/µl] = Absorption (260 nm) x Faktor

(wobei Faktor = Probenspezifischer Faktor x Virtueller Verdünnungsfaktor)

Der probenspezifische Faktor repräsentiert die spezifische Absorption, bei der beispielsweise eine Probe mit 50 ng/µl dsDNA einen Absorptionswert von 1 Abs (A260) aufweist, gemessen mit einer Schichtdicke von 10 mm in einer herkommlichen Küvette. Aufgrund der zur Auswahl stehenden Schichtdicken von 0,2 mm und 1 mm bei der TrayCell muss daher zusatzlich der virtuelle Verdünnungsfaktor (50 bzw. 10) berücksichtigt werden.

Fur die unterschiedlichen Nukleinsäure-Arten ergibt sich der mittlere dynamische Bereich der Konzentration (ng/µl) in Abhängigkeit von der optischen Schichtdicke wie folgt:

1 mm Deckel
(Virtueller Verdünnungs-
faktor 10) [ng/µl] *
0,2 mm Deckel (Virtueller Verdünnungs-
faktor 50) [ng/µl] *
Gesamt-
mess-
bereich [ng/µl] *
dsDNA13 – 85063 – 42506 – 8500
ssDNA9 – 62946 – 31455 – 6290
ssRNA10 – 68050 – 34005 – 6800
Oligo8 – 56141 – 28054 – 5610
* typische, mit einem durchschnittlichen Photometer messbare Konzentrationswerte

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